Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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