Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXD3Q9UJU5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXD3Q9UJU5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXD3Q9UJU5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXD3Q9UJU5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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