Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIMS3Q9UJD0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms