Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms