Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNTN3Q9P232 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms