Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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