Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KCMF1Q9P0J7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms