Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms