Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CIPCQ9C0C6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CIPCQ9C0C6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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