Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms