Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms