Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms