Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLF1Q9BQI6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms