Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHP1Q99653 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHP1Q99653 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms