Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms