Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms