Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms