Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms