Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms