Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms