Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG4Q92954 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms