Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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