Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms