Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PBRM1Q86U86 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBRM1Q86U86 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms