Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms