Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms