Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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RAB6CQ53S08 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RAB6CQ53S08 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RAB6CQ53S08 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RAB6CQ53S08 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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