Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms