Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms