Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms