Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms