Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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