Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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