Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms