Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ALX1Q15699 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ALX1Q15699 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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