Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TRIP13Q15645 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms