Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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CDSNQ15517 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CDSNQ15517 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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