Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms