Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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