Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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