Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKG1Q13976 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms