Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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