Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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