Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMB3Q13751 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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