Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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