Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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