Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SRSF6Q13247 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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SRSF6Q13247 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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