Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RLFQ13129 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RLFQ13129 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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