Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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IFT88Q13099 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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