Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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